Od 1.10.2019 r. struktura Instytutu uległa zmianie – między innymi zakłady zostały przekształcone w katedry. 

• Katedra Badań nad Edukacją Geograficzną
• Katedra Ekorozwoju i Kształtowania Środowiska Geograficznego
• Katedra Geologii
• Katedra Geografii Fizycznej
• Katedra Geoinformacji i Badań Geośrodowiskowych
  • Zespół Badań Sedymentologicznych
• Katedra Geografii Społeczno-Ekonomicznej
• Katedra Przedsiębiorczości i Gospodarki Przestrzennej
• Katedra Turystyki i Badań Regionalnych
  • Zespół Interdyscyplinarnych Badań w Turystyce

• Zespół Badań Geoinformacyjnych
• Zespół Badań Edukacji w zakresie Przedsiębiorczości

• Biblioteka Geograficzno-Biologiczna (do 2016 Biblioteka Instytutu Geografii, a w latach 2016-2019 Biblioteka Wydziału Geograficzno-Biologicznego)
• Zbiory Kartograficzne